勤于管理 原生態養豬并非“懶漢養豬”.原生態養豬雖然具有省工、省料、省水的特點，但原生態養豬不等于一勞永逸，豬放進去就完事，其中墊料管理是關鍵。管理的目的是給墊料中的有益菌創造良好的生活環境，使其能正常地生長繁殖，形成強勢菌群。
    濕度控制 墊料管理的核心是墊料的濕度控制，墊料表面以下20厘米水分控制在50%~60%比較合適。以手握不滴水，指彈不成團，手心有濕氣，手掌無水珠為宜。墊料表面20厘米以上濕度控制在45%左右，水分低于35%容易起粉塵，造成豬的咳嗽和喘氣病，高于45%表層分解加快，特別在夏天會造成表層溫度高，不利于豬只在墊料上休息和活動，在濕度低于35%時，應在墊料表層灑適量的水；若墊料太濕，氨氣味較濃，應加強通風，或加入適量新的鋸末、谷殼、秸稈等墊料，上下翻動一遍，并補充適量的HM墊料發酵基。
    日常管理 日常管理是墊料運行良好的關鍵。日常管理主要是在糞便比較集中時，把糞便集中掩埋，提高糞便降解速度。
    因抗生素對微生物具有殺傷作用，使微生物活性降低，飼料中**不要加入抗生素類藥物。墊料外部可使用消毒劑消毒，以抑制有害菌的生長。
    墊料的夏季管理 夏季氣溫較高，且墊料分解糞便要散發一定熱量，很多人擔心夏季能否安全度過。其實完全沒有必要擔心，該公司在福建等地經過多年實驗，在***帶完全可以安全越夏，只是更需要加強墊料管理。
    夏季使用時可將墊料的厚度降低20厘米。在飼養過程中，墊料豬的排糞區要經常翻動，豬的趴臥區不要進行翻動，由于發酵營養源的缺乏，其發酵效率得到抑制而使墊料表面涼爽。夏季天氣熱時要加強通風，有條件可以采用負壓式通風、水簾降溫或在飲水中加些綠豆水。